Обычно синовиальная жидкость бесцветная или светло-жёлтая и довольно вязкая. Анализ синовиальной жидкости начинается с её сбора и оценки на наличие примеси крови. Если жидкость сначала прозрачная, а затем становится кровянистой или изначально кровянистая, а затем становится прозрачной, то, скорее всего, имеется примесь крови. Если жидкость остаётся кровянистой на протяжении всего сбора, то это может быть внутрисуставное кровотечение или примесь крови.
Если собрано достаточное количество жидкости, то её следует поместить в пробирку с антикоагулянтом ЭДТА (ЭДТА сохраняет морфологические особенности клеток и подавляет рост бактерий). Иногда удается получить только небольшое количество жидкости, которой хватает для приготовления 2–3 мазков. В идеале это должны быть «раздавливающие» мазки из-за вязкости жидкости. Мазки следует быстро высушить на воздухе. Ускорение высушивания, например, с помощью фена – достаточно спорно, так как избыточный нагрев может вызвать артифициальные изменения морфологии клеток, такие как коагуляция и последующее сжатие. На мазках и пробирках должна быть указана идентификационная информация о пациенте, дата и сустав, из которого была взята жидкость. Необходимо предоставить полную историю болезни с соответствующими подробностями (например, полиартропатия, поражение одного сустава, предшествующая операция, симптомы, дифференциальный диагноз, результаты рентгенографии, если они известны, титры инфекционных заболеваний и т. д.). Пробирки следует хранить в холодильнике, а мазки – при комнатной температуре и как можно скорее доставить в нашу лабораторию.